养鱼最麻烦的一点就是换水。动物排泄、饲料等有机物分解都会使水体变脏变浑浊，既影响观赏又有害水族健康。淡水水族箱一般要求每周换水，但对于咸水水族箱而言，因为对水体环境、咸度、温度都有较高要求，不能经常换水，就需要器材辅助完成清洁和过滤的工作。

蛋白分离器能够吸附污垢将其打散然后排出，一般用家可能会选择这种方式来清除水里的废物。不过近两年则流行起了“水族魔法术”，就是利用细菌在鱼缸中营造出动态循环，用生物分解取代物理分解，实现鱼缸循环“生态化”。